Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pou3f1P21952 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms