Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms