Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Irf1P15314 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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