Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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H2-Eb1P04230 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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H2-Eb1P04230 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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H2-Eb1P04230 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2-Eb1P04230 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms