Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P01641 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P01641 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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