Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lnx1O70263 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms