Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
BC024978J3QPC3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms