Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3002E9PW72 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms