Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Prrt4B2RU40 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms