Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slfn8B1ARD8 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms