Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Higd1aQ9JLR9 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257.8 ms