Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Trim39Q9ESN2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trim39Q9ESN2 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms