Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ccdc83Q9D4V3 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccdc83Q9D4V3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms