Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rfc5Q9D0F6 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rfc5Q9D0F6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rfc5Q9D0F6 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rfc5Q9D0F6 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rfc5Q9D0F6 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms