Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc47Q9D024 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc47Q9D024 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms