Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Pkp2Q9CQ73 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms