Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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Commd4Q9CQ02 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
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Commd4Q9CQ02 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Commd4Q9CQ02 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Commd4Q9CQ02 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Commd4Q9CQ02 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Commd4Q9CQ02 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Commd4Q9CQ02 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Commd4Q9CQ02 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Commd4Q9CQ02 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Commd4Q9CQ02 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Commd4Q9CQ02 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Commd4Q9CQ02 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms