Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Krt88Q9CPR6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms