Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

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Length 1,463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rims1Q99NE5 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rims1Q99NE5 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms