Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lims1Q99JW4 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Lims1Q99JW4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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