Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rnf144aQ925F3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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