Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubxn4Q8VCH8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubxn4Q8VCH8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms