Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Card11Q8CIS0 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Card11Q8CIS0 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms