Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Csnka2ipQ8CH19 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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