Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cdkl1Q8CEQ0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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