Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms