Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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FarsaQ8C0C7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
FarsaQ8C0C7 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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