Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Lrrtm2Q8BGA3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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