Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbtb40Q6PCS8 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbtb40Q6PCS8 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbtb40Q6PCS8 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbtb40Q6PCS8 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbtb40Q6PCS8 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbtb40Q6PCS8 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbtb40Q6PCS8 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbtb40Q6PCS8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Zbtb40Q6PCS8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Zbtb40Q6PCS8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Zbtb40Q6PCS8 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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