Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nop58Q6DFW4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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