Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Pkp4Q68FH0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Pkp4Q68FH0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkp4Q68FH0 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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