Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ifit1Q64282 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ifit1Q64282 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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