Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ccdc18Q640L5 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ccdc18Q640L5 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Ccdc18Q640L5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Ccdc18Q640L5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Ccdc18Q640L5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Ccdc18Q640L5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm8828-201ENSMUST00000196786 1290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc18Q640L5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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