Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Gm15369-201ENSMUST00000119681 394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gli3Q61602 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gli3Q61602 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gli3Q61602 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gli3Q61602 Gm5432-201ENSMUST00000180759 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gli3Q61602 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gli3Q61602 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Gm33180-201ENSMUST00000217109 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms