Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Usp48Q3V0C5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp48Q3V0C5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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