Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Kdm5aQ3UXZ9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Kdm5aQ3UXZ9 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Kdm5aQ3UXZ9 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms