Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms