Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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D13Ertd608eQ3UPR8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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