Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Usp30Q3UN04 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Usp30Q3UN04 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms