Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sec24aQ3U2P1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sec24aQ3U2P1 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.8 ms