Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctdnep1Q3TP92 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms