Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Prpf6-201ENSMUST00000002529 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 4930568E12Rik-202ENSMUST00000216694 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Ces5a-201ENSMUST00000077816 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccbe1Q3MI99 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Zbtb37-201ENSMUST00000159250 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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