Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rpusd2Q149F1 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rpusd2Q149F1 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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