Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Siah1bQ06985 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms