Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms