Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AlkP97793 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
AlkP97793 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
AlkP97793 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.14
AlkP97793 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AlkP97793 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AlkP97793 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms