Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms