Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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