Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gfi1P70338 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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