Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RorcP51450 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RorcP51450 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RorcP51450 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RorcP51450 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms